提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
香港玩具展揭幕 内地参展商冀开拓新客源******
中新社香港1月9日电 (记者魏华都)由香港贸易发展局(香港贸发局)主办的第49届香港玩具展9日在香港会议展览中心揭幕,逾250家内地商家来港参展。有内地参展商表示,期望借着今次机会寻找新客户,带动公司的业绩。
今届香港玩具展为期4天,同场举行的还有第14届香港婴儿用品展、第21届香港国际文具及学习用品展,也是香港与内地“通关”后首项实体展览,3个展览汇聚超过1000家展商,来自17个国家及地区。
记者走访展览现场所见,玩具展有来自香港、土耳其、马来西亚和内地等地的参展商,展出遥控车、玩具飞机、大型公仔、玩具飞镖、玩具枪和模型等产品,大多是新颖款式,但部分具有怀旧风格。场内气氛活跃,商家与买家互相攀谈,了解对方的产品和价格,希望促成交易。
来自汕头的参展商智速玩具实业有限公司,其摊位相当热闹,一群印度买家对其产品感兴趣,不断向业务员询问详情。该公司一名业务员接受中新社记者采访时说:“参展第一天我们的摊位非常热闹,这些印度买家是我们的新客户,过来了解玩具的价格和款式,而我们今年带来了很多新款产品。”
他说:“我们公司开设已经10多年了,客户遍布东南亚、欧洲和南美等。以前我们有来香港参展,但这几年受疫情影响暂停了,生意也受影响。今年很多旧客户希望见到我们,他们希望增加订单,我们也有一些新产品介绍给他们。”
他还说:“与在内地参加展览比较,在香港参展更能够直接接触到外国买家,因此希望通过这次展览增加新客户、联络旧客户,追回疫情期间受影响的业绩。”(完)
(文图:赵筱尘 巫邓炎)